内蒙古社会主义学院的前身是成立于1956年7月的内蒙古政治学校，1960年3月政治学校改名为内蒙古社会主义学院，为副厅级事业单位。党的十一届三中全会以后，中共中央书记处于1982年决定，尽快恢复各省、市、自治区社会主义学院或政治学校。1990年1月，经自治区党委常委会议决定，成立内蒙古社会主义学院筹备小组。1991年6月自治区机构编制委员会批复，同意复办内蒙古社会主义学院，受自治区党委统战部领导，相当于副厅级事业单位。1992年4月，复办后首期培训班——民主党派基层组织负责人培训班开学。2009年，内蒙古社会主义学院正式升格为受自治区党委领导的正厅级事业单位。领导班子成员由自治区政协副主席、党委统战部副部长、常务副院长、副书记、副院长等组成。